Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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