Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
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