Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC10A1Q14973 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC10A1Q14973 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC10A1Q14973 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC10A1Q14973 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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