Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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