Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD9Q14511 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD9Q14511 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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