Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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