Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL3Q13618 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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