Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATRQ13535 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATRQ13535 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms