Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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