Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms