Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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