Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF5Q13243 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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