Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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