Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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