Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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