Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWF1Q12792 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWF1Q12792 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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