Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms