Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms