Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms