Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN5Q08AF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms