Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX9Q08211 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX9Q08211 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX9Q08211 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DHX9Q08211 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DHX9Q08211 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms