Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms