Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD51Q06609 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms