Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms