Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP1Q04837 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms