Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1Q04771 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms