Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms