Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms