Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB1Q02641 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms