Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHLH2Q02577 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms