Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms