Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD4Q01804 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms