Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF9Q00978 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms