Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VLDLRP98155 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VLDLRP98155 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms