Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBX1P83916 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX1P83916 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX1P83916 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms