Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRX1P78414 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX1P78414 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRX1P78414 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms