Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTG1P63261 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTG1P63261 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG1P63261 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms