Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKP1P63208 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKP1P63208 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP1P63208 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKP1P63208 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP1P63208 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP1P63208 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms