Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO1P63165 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms