Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL23P62829 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL23P62829 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL23P62829 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL23P62829 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms