Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB1AP62820 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB1AP62820 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms