Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMO4P61968 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO4P61968 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO4P61968 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMO4P61968 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMO4P61968 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms