Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms