Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00313P59037 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00313P59037 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms