Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX9P55771 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX9P55771 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms