Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP6P55212 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP6P55212 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP6P55212 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP6P55212 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP6P55212 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP6P55212 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP6P55212 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms