Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP7P55210 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP7P55210 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP7P55210 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP7P55210 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP7P55210 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP7P55210 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms