Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELLP55199 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELLP55199 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ELLP55199 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ELLP55199 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ELLP55199 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELLP55199 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms