Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2E1P51965 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms