Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPT1P50897 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPT1P50897 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPT1P50897 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPT1P50897 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms